Predseníctvo ZHK SR pripravuje zásadné pripomienky k návrhu zákona o finančnej kontrole a audite vykonávanom verejnou správou, pretože nie je v dostatočnej miere aplikovateľný v územnej samospráve pri výkone kontroly hlavného kontrolóra obce. Ako je uvedené v dôvodovej správe tvoril sa z dôvodu zachovania jednej z požiadaviek prístupového procesu Slovenskej republiky do Európskej únie, ako aj komplexnosti služieb, ktoré vnútorný audit ponúka vedúcemu správcu kapitoly štátneho rozpočtu oproti následnej finančnej kontrole. Preto predstavitelia Združenia hlavných kontrolórov miest a obcí Slovenskej republiky požadujú komplexnejšie pripraviť tento zákon, aj v súvislosti s výkonom kontroly hlavných kontrolórov na obciach.